请问得到测序结果后,怎么在BLAST里证明测序的结果是我要的目的片段!
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/06/24 00:55:26
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请问得到测序结果后,怎么在BLAST里证明测序的结果是我要的目的片段!
请问得到测序结果后,怎么在BLAST里证明测序的结果是我要的目的片段!
请问得到测序结果后,怎么在BLAST里证明测序的结果是我要的目的片段!
1.首先把测序后的序列和你目的基因的序列都拿到
2.到这个网页
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch&PROG_DEF=blastn&BLAST_PROG_DEF=megaBlast&SHOW_DEFAULTS=on&BLAST_SPEC=blast2seq&LINK_LOC=align2seq
3.在上面的大空格放入测序得到的序列,下面的那个放入目的基因的序列,为Job Title起一个名字.然后点“BLAST”就可以了.
4,结果会显示2个序列是否一致,有无变异等等.
将你自己的目的片段与测序结果一起输入(有两个填入的框)
然后软件会为你比对
你就可以知道测序结果中是不是包含你的目的片段,并且还可以知道是否发生的突变
当然你也可以采用最麻烦的方法
就是自己把你的目的片段序列与测序结果比对
呵呵
可以用NCBI上的Blast
比较方便...
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将你自己的目的片段与测序结果一起输入(有两个填入的框)
然后软件会为你比对
你就可以知道测序结果中是不是包含你的目的片段,并且还可以知道是否发生的突变
当然你也可以采用最麻烦的方法
就是自己把你的目的片段序列与测序结果比对
呵呵
可以用NCBI上的Blast
比较方便
收起
如果你没有这一段序列的话先获取着一段序列,进入ncbi首页,然后search后面database选nucleotide,输入你的序列关键词(你测序总有个基因什么的关键词是吧,如果你有着一段序列的代号就这届输入),获取你的目的序列的正确序列,把genebank格式切换到fasta(希望这几个字母没打错,我总觉得信息学的老师有种拍死我的冲动)格式,然后复制这一段序列
如果你手上有这一段序列的编...
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如果你没有这一段序列的话先获取着一段序列,进入ncbi首页,然后search后面database选nucleotide,输入你的序列关键词(你测序总有个基因什么的关键词是吧,如果你有着一段序列的代号就这届输入),获取你的目的序列的正确序列,把genebank格式切换到fasta(希望这几个字母没打错,我总觉得信息学的老师有种拍死我的冲动)格式,然后复制这一段序列
如果你手上有这一段序列的编码,那么直接进入ncbi首页,选择blast,选择nucleotide blast,然后你可以看到在输入序列的框下面有Align two or more sequences ,在前面的小框里打钩,上面一个框输入你的目的序列,下面一个框输入你的测序序列,就可以输入你的目的序列和测序结果了,如果结果看的不太懂的话可以接着来问啊
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在Blast的结果中看和你测序得到的片段100%匹配的序列如果是你的目的片段,那就证明没有问题